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研究领域为涎腺疾病，发表论文十余篇，其中2篇被SCI收录，博士学位论文获得教育部优秀博士学位论文，其相应的研究成果作为《涎腺放射损伤功能重建研究》一部分，获得2008年中华医学科技奖，单兆臣是第二完成人。2007年作为访问学者去英国伦敦大学国王学院牙科学校研修。目前，承担国家自然科学基金、教育部的优秀博士论文专项资助课题和北京市优秀人才资助课题。