邛崃市中医医院成立于1956年, 1983年由原县中医院和原城关医院合并组建邛崃县中医医院，1994年医院随邛崃撤县建市更名为“邛崃市中医医院”，现为集医疗、教学、科研、养生、保健、康复“六位一体”的三级乙等中医（综合）医院。

目前，医院占地面积23203㎡，建筑面积39452㎡，设南环路院区和西街院区；编制床位526张，开放床位630张。现有临床科室20个，医技科室8个，中医特色门诊18个；其中四川省中医重点专科2个（肿瘤科、儿科），成都市中医重点专科2个（针灸科、糖尿病科），邛崃市医学专科6个，设置医疗美容科；有省、市名中医工作室3个；常年开展黄帝内针、原始点疗法等60余项中医适宜技术。

医院迁建项目已于2020年10月启动，新院区占地面积67亩，建筑面积9.3万㎡，设置医疗床位800张，预计2024年完工投入使用。

医院现有职工560人，其中高级职称69人，博士研究生3人，硕士研究生43人。有四川省、成都市名中医6人；全国中医临床优秀人才1名，全国老中医药专家学术经验继承人1名，国医大家学术经验传承班培养对象2人，四川省中医药管理局学术和技术带头人及后备人选各1名，成都市首批中医临床优秀人才培养对象2名。

医院现拥有GE 1.5T MRI、GE 64排128层螺旋CT、飞利浦彩超、Wolf高清腹腔镜、进口高清电子胃肠镜、碎石机、骨密度仪、口腔全景牙片机、皮肤镜、强脉冲激光、进口飞利浦无创呼吸机、进口哈美顿有创呼吸机等医疗及康复设备。医院还将计划新增和增添直线加速器、数字化血管机、肿瘤热疗机、血液透析设备等价值6000余万元医疗设备。

医院为邛崃市中医药适宜技术推广基地，并与社区卫生服务中心及6个卫生院建立邛崃市中医医院健康管理集团；与成都中医药大学附属医院、四川省第二中医医院、四川大学华西第二医院、四川省肿瘤医院建立医联体，为四川省消化道早癌标准化治疗、成都市内分泌疾病等专科联盟单位；为中国医学科学院整形外科医院（西南中心）成都八大处医疗美容医院“临床合作基地”并共建“整形美容学科”，眉山药科职业学院非直管附属医院。

医院现为全国县级医院综合能力全面提升试点单位、四川省老年友善医疗机构，获评中共四川省委、四川省人民政府脱贫攻坚先进集体、成都市对口支援藏区工作先进集体，医院党委获评成都市委组织部先进基层党组织。