怒江州人民医院病理室始建于1989年9月，归属检验科分管。自2014年8月从检验科分出，成为独立科室，购入了脱水机、切片机、包埋机、冰冻切片机、显微镜等设备，使得病理科进一步发展壮大，病理标本量由10余例/月到近300例/月。为了更好的发展病理科，应对更高的临床需求，提高医院医疗技术水平，2017年5月新增了600余万的设备，除了增加了一套包埋机、烘片机、切片机、摊片机、脱水机等设备之外，更是新添了自动染色机、免疫组化设备、液基细胞制片机等设备。

目前，病理科拥有3名诊断医生（2名中级职称、1名初级职称），3名技术员。开展常规病理检查、脱落细胞学检查、细胞沉渣蜡块、宫颈液基细胞学检测、宫颈HPV定量检测、术中快速冰冻切片诊断，通过远程数字化病理能解决疑难病理会诊及免疫组化、特殊染色等检查。