2001年入选浙江省中管局颈腰椎病重点专科，2002年建立康复治疗区（PT），2004年组建康复中心和温医康复系，全国针灸临床研究中心温州分中心挂牌。2006年陆续建立作业疗法区（OT）、言语和认知治疗室（ST）。2016年，联合温医大基础医学院、生命科学院等与杨观虎博士等美方康复医学和针灸学交叉学科专家团联合建立中美针灸康复研究所，作为开放平台进行临床、基础和工程及传统医学多学科结合的智能康复和整合优化医学研究。

• 科室开展神经系统、肌肉骨骼系统、心血管系统等疾病，肿瘤术后淋巴水肿、常见外科手术后、盆底功能障碍，风湿病、骨质疏松、言语与语言障碍、前庭功能障碍等的康复。特色技术包括高效强化分级运动训练技术，日本川平促通康复技术，三维步态、平衡与协调综合评定与情景训练，手功能精细评估和多系统情景互动训练等。研发应用颈椎曲度矫治枕、加强U型枕等辅具。