南京脑科医院中医科建立于1956年。科室自成立以来一直致力于神经、精神类疾病的中医治疗工作。现为国家中医管理局神志病重点专科培育单位南京市中医重点专科。
目前科室有医生12人，其中南京市名中医一人，主任中医师2人，副主任中医师3人，博士后1人，在读博士2人。护理16人，其中副主任护师3人。2008年因科室发展需要，专设了独立的中医科病房（现204病区）。拥有床位30张，病区内设置有病区针灸室及中医特色治疗。目前科室由中医科门诊、中医科病房、门诊针灸室构成。门诊开设有普通门诊、中西医结合脑病、中医神志病、中医帕金森病、失眠等多个专病门诊。科室主要优势病种有中风、中风后遗症、面瘫、眩晕、颤证、头痛、痴呆、带状疱疹、颈腰椎疾病、失眠、抑郁症、焦虑症等。

科室近几年坚持中医药发展方向，积极开拓思路，形成了良好的中医药氛围，学科建设取得了较大的发展。住院病人中药使用率超过80%，中医治疗率超过85%。中药使用颗粒剂以及中药水剂等多种剂型，使用方式多样，内服、外用互为补充。中医治疗技术手段多样化，拥有中医经络检测仪、中药熏蒸治疗仪、电脑红外音乐按摩理疗床、整脊治疗仪、电脑中频治疗仪、脑电治疗仪、电针仪、TDP等中医药治疗设备20余件，广泛开展针灸、火罐、耳穴压豆、穴位敷贴、督灸、隔物灸、刮痧、中药熏药、放血疗法、埋线疗法、埋针疗法等中医治疗技术25类近60种项目。放血疗法、埋线疗法、整脊疗法为院内新技术。科室主持参与国家、省、市级科研项目8项，发表论文30余篇，拥有国家新型实用专利10余项。

特色技术介绍

刺络放血疗法：刺血疗法是在中医基本理论指导下，通过放血祛除邪气而达到和调气血、平衡阴阳和恢复正气目的的一种有效治疗方法，适用于“病在血络”的各类疾病。 临床上，医师在治疗前评估患者体质的强弱、气血的盛衰以及疾病的虚实属性、轻重缓急等情况，详察形神、辨明虚实、定其血气、顺应时令，常规消毒后进行操作，放血手法轻、浅、快、准，深度约0.1～0.2寸，一般出血量以数滴至数毫升为宜。常用方法有：点刺法、围刺法、针罐法等。
适应症：内科疾病（感冒、发热、头痛等）、皮肤科疾病（如带状疱疹及其后遗神经痛、湿疹、痤疮等）、骨科疾病（如腰扭伤、踝扭伤等）、眼科疾病（如麦粒肿）等。气滞血瘀型失眠患者可选酌此法。
穴位埋线疗法：是中医外治法中最为常见的方法之一，是在针灸理论的指导下，医师进行辨病辨证诊断制定出适宜的处方配穴，将医用肠线埋入相应穴位，借助埋入线体对穴位产生持续刺激作用而替代传统针灸治疗，达到疏通经络、调节气血、平衡阴阳、调理脏腑的作用。基于针灸治疗中的“留针法”，每次埋线可持续10-15天，具有长效无痛、安全简便的优势。
适应证：具有广泛性，一般来说，凡能用针刺疗法治疗的疾病，均可应用埋线疗法治疗，目前临床上主要应用于神经系统疾病（如失眠、中风、癫痫等）、胃肠疾病、肺系疾病、痛症、妇科疾病及内分泌疾病等。尤其对于慢性失眠等，省时简便，疗效持久。