1974年5月4日在全国率先组建了临床医学工程学科——医学电子室(即临床医学实验室)。1978年引进计算机系统(DJS-131)，同年根据工程需要改组为电子仪器室和计算机室。1979年被总后卫生部选定为全军医学电子工程中心。1984年5月电子仪器室、计算机室和药局修理组合并成立医学电子科。1987年11月由医学电子科分出部分计算机专业人员后改名为生物医学工程科，是全军医学电子技术中心的组成部分。1998年器材科与工程科合并为医学工程器材科。2004年又更名为医学工程科。2006年被评为南京军区临床医学工程中心。2017年第八届“中国好医工”中国优秀临床工程师评选获医院团队十佳第一名。