胃肠肛门外科是广东医科大学附属第二医院消化道外科特色专科之一，是湛江市重点建设专科，包括腹部微创外科、微创胃肠肿瘤外科、结直肠肛门及盆底微创外科（肛肠微创中心）。是中华中医药学会肛肠分会常务理事，湛江市医学会结直肠肛门（肛肠）外科分会主任委员单位肛肠疑难疾病会诊中心。现有医护人员数共29人。医生12人：正高职称3人、副高职称2人、主治医师2人、住院医师5人;硕士4人，在读硕士2人。

科室技术力量雄厚，现配备床位39张，年手术量达2000台以上。拥有“全国肛肠学科名专家” 、“岭南名医”专家团队，拥有多个先进设备，如裸眼3D腹腔镜、荧光腹腔镜、马镫形多功能腿架、胃肠动力治疗仪、中药熏蒸治疗机等等。科室由多名具有丰富临床经验的胃肠肛门外科及微创胃肠肿瘤专家主诊，与消化内科、肿瘤中心、影像中心、病理科等组成多学科治疗团队（MDT）模式，有效提高诊疗水平，并与多家权威三甲医院如中山大学附属第六医院、广东省人民医院、珠江医院、广东省中医院等开展技术合作。

科室特色技术：

开展消化道肛门疾病疑难手术及腹腔镜微创手术，运用现代微创技术治疗胃结直肠恶性肿瘤、消化道及腹部肿瘤、结直肠息肉、重度痔病、复杂性肛瘘、直肠脱垂、肛裂、溃疡性结肠炎、顽固性便秘、各种巨结肠、肛门畸形，在粤西地区处于领先地位。开展腹腔镜胃癌根治术、腹腔镜结直肠癌根治术，微创直肠癌低位保肛术，其中开展腹部无辅助切口经自然腔道取标本的腹腔镜直肠癌根治术（NOSES术）及腹腔镜胃癌D2根治术，取得良好疗效；在湛江地区率先开展经肛门微创手术(TAMIS)，显著提高保肛率，极大地改善术后患者生活质量；在粤西地区率先采用多项先进微创技术治疗痔病，其中开展：注射疗法、套扎疗法、超声刀痔切除术、吻合器痔上黏膜环切钉合术（PPH）、选择性痔上黏膜切除术（TST）及自动痔疮套扎术（RPH）等微创技术，直肠脱垂Delorme,Altemeier手术，经肛治疗直肠脱垂手术及三联术，藏毛窦切除改良Limberg法皮瓣移植术，陈旧性重度会阴-肛门撕裂伤修补术。开展微创Lift复杂性肛瘘，术后疼痛最低，疗效满意。