眼科现有副主任医师一名，目前配备有Leica手术显微镜、Odm眼科A/B型超声彩断仪、Canon全自动眼压计、YZ角膜曲率计、尼德克全自动免散瞳眼底照相机。可开展眼科常见病、多发病的诊断与治疗，包括部分眼表手术及小儿验光配镜等。2018年初起医院纳入厦门大学附属翔安医院管理，科室建设、管理、人才和设备等与附属翔安医院融合，为本学科的发展提供了新的机遇。