眼科是医院特色科室，设置眼科门诊及住院部，凭借精湛的诊治技术和先进设备，眼科患者能得到极好的医疗诊治服务。科室目前有医生8名，其中副主任医师1名，主治医师1名，住院医师6名，专科护理人员3名，验光师4名。

配备眼视光系统、数码裂隙灯，角膜地形图，生物测量仪，OCT，眼前节及后节激光，干眼脉冲治疗仪，雾化设备，眼科A/B超，超声乳化仪，蔡司飞秒激光仪等。业务范围以白内障及青少年近视防控等为专科特色，对高原常见病如翼状胬肉等有丰富的手术经验。同时兼顾各种类型的屈光不正（近视，远视，散光，老视）的诊治，弱视及斜视的诊治；眼科各类疑难杂症的诊治。

2021年医院眼科被选定为海东市唯一的儿童青少年近视防控指导中心，为海东市在校学生进行免费近视筛查及指导。为解决广大白内障患者的疾苦。从2022年起开展白内障减免手术，为防盲致盲做出了贡献。多次派医护人员赴全国知名眼科培训基地学习，为更好地服务于患者。