内镜是消化科医生的“眼睛”，是诊断消化道疾病的重要设备，它包括胃镜和肠镜及其配套设备。自上世纪八十年代初开展内镜检查以来，已完成胃镜检查超过8万人次，肠镜检查近1万人次，内镜普查1.5万人次，从单一检查发展到现在能开展多项内镜诊治技术。

该室拥有多台电子胃镜、肠镜系统，同配备电子图像处理、中央信息管理及激光彩色打印系统。有主任医师、主治医师、住院医师、技师及护师数名，操作内镜均超过万例，并相继从师于上海瑞金医院和上海长海医院的全国著名消化内镜专家、教授，具有娴熟的内镜操作水平和丰富的临床诊治经验，擅长早期食管癌、胃癌的诊断。另外，内镜室还开展了粘膜染色（Lugol,s染色）查早期食管癌的的新项目，2006年成为卫生部食管癌早诊早治示范点，2009年又成为十一五国家支撑项目胃癌的预防研究。同时开展无痛胃、肠镜检查已十余年，目前有30%的患者进行此项检查，相继开展了下列内镜下治疗项目：急诊内镜下止血、取食管异物、吻合口狭窄的扩张术、内镜下硬化剂的治疗及圈套技术，已开展了内镜下早期癌的粘膜切除术（EMR）和粘膜剥离术（ESD）。

近期他们又相继引进了13C呼气试验方法。

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