厦门市中医院药学部，是集药事管理、药学服务等于一体的药学专业技术科室，目前在职员工108人，其中高级职称药师18人，中级职称药师37人，国家中药特色技术传承人才9名。药学部下设门诊中药房、病区中药房、煎药房、门急诊西（中成药）药房、病区药房、临床药学室、制剂室等多个部门，除保障临床所需药品的采购、质量管理、调剂、医院制剂配制等工作外，药学部积极开展以“以合理用药为核心”的临床药学工作，包括处方点评、药师参与查房、药学门诊、不良反应监测、抗菌药物专项治理、药学信息服务、教学科研等多项工作，努力为临床提供多元化的药学技术服务。厦门市中医院是全省规模最大的三级甲等中医院之一，药学部每年接收培训省内外药学及临床实习生80余人。2017年，获批成为中华中医药学会中药临床药师培训基地，每年招收脾胃病科和儿科专业学员数名。2019年，我科获批成为福建省首批中药临床药学重点专科创建单位。科研方面：近5年，发表药学相关学术论文100余篇；参编《医院药师日记》、《中药注射剂安全应用案例分析》等临床药学专业书籍；主持国家级、省市级、福建中医药大学校管等课题10余项。获得荣誉：
2010年，药学党支部获厦门卫生系统“先进基层党组织”荣誉称号；
2011年，获国家食品药品监督管理局“全国药品不良反应工作先进单位”荣誉称号；
2015年，药师彭清华、郭瑶尝取得第一届全国药师技能大赛厦门赛区第一名；
2015年，中药房获得厦门市总工会颁发的“工人先锋号”荣誉称号；
2015年，中药房获厦门市级“青年文明号”荣誉称号；
2016年，药师陈水钫、张伟萍取得第二届全国药师技能大赛厦门赛区第一名；
2016年，中药房获福建省级“青年文明号”荣誉称号；
2017年，西药房获厦门市级“青年文明号”荣誉称号；
2017年，获批成为中华中医药学会中药临床药师培训基地；
2019年，获批成为福建省首批中药临床药学重点专科创建单位；
2020年，药师舒文琳获得2020年全国药学服务经典案例评选厦门赛区一等奖；
2021年，谢淳甸、徐韵菁获得第七届全国药师技能大赛厦门赛区二等奖；
2021年，郑重践获得2021年全国药学服务经典案例评选厦门赛区二等奖；
2021年，蔡颖莲获得首届厦门市执业中药师职业技能短视频科普大赛一等奖；
2021年，福建省中药传统技能大赛（福建省卫生健康委员会、福建省总工会主办）团体总分第一、陈雪梅获优秀指导老师、陈文娟个人总分第一并获得“五一劳动奖章；