自1985年医院成立消化内分泌科以来，历经30余年，科室不断发展壮大，内分泌遗传代谢科于2013年独立成科，目前是西北地区唯一的儿童内分泌遗传代谢病专科，承担全陕西省及周边地区儿童内分泌遗传代谢病的临床诊治工作，同时辐射甘肃、山西、河南、新疆、宁夏、青海等地区。病房共开放床位53张，医护人员共32名，其中高级职称5名，中级职称18名。各种原因导致的身材矮小（矮小症）：生长激素缺乏症、特发性矮小、家族性矮小、小于胎龄儿等等；生长发育迟缓；性早熟；乳房早发育；糖脂代谢异常：儿童1型糖尿病、2型糖尿病、各种特殊类型糖尿病、低血糖、高脂血症； 肥胖症；性发育异常；性发育迟缓；两性畸形；小阴茎；性腺发育不良；自身免疫性多腺体病综合征；水盐代谢酸碱失衡：多饮多尿、低钠血症、低钾血症、高钾血症、尿崩症、代谢性酸中毒等；甲状旁腺疾病；佝偻病；高钙血症；软骨发育不良；甲状腺疾病：甲亢、甲低、甲状腺炎；肾上腺疾病：肾上腺皮质增生症、肾上腺皮质功能不全、皮质醇增多症、醛固酮增多症；遗传代谢病：氨基酸代谢病、有机酸代谢病、脂肪酸代谢病、尿素循环障碍、溶酶体贮积症、线粒体病等。