黑龙江省第三医院神经外科创始于1962年，具有悠久的历史，为黑龙江省北部地区神经外科中心。是继哈尔滨医科大学之后，省内建立较早的专业科室之一，集科研、教学、医疗于一体。经过多年的发展，现有主任医师1名、副主任医师2名、主治医师2名、医师4名。主任护师1名、主管护师1名、护师9名、护士11名。设立床位68张.其中ICU病房床位12张。

　　科室开展的业务范围：神经胶质瘤、脑膜瘤、听神经瘤、颅底肿瘤、颅内转移瘤等显微外科治疗，颅内动静脉畸形切除术、动脉瘤夹闭术、垂体瘤经颅、经鼻蝶窦的显微外科治疗，高血压性脑出血、颅脑损伤、烟雾病、脑脓肿、脑囊虫、脑积水、颅骨畸形、颅骨骨瘤、三叉神经痛、面肌痉挛、颅内蛛网膜囊肿，Arnold-chiari畸形、脊髓空洞、癫痫的外科治疗，脊髓肿瘤、外伤、颈、腰间盘突出的手术治疗。

　　特色治疗：立体定向治疗精神病、脑出血、脑脓肿，弹簧圈栓塞动脉瘤治疗，支架治疗颈内动脉、椎动脉系统血管狭窄、介入治疗颈内动脉海绵窦瘘、动静脉畸形、脑膜动静脉瘘，脑梗塞的支架拉栓治疗，填补黑河地区的空白。近年来开展的亚低温治疗大大提高了颅脑损伤的治疗率。高血压出血的微创手术治疗，降低了手术费用，减少住院天数，大大减少瘫痪的发生率。显微镜的临床应用已开展15年，更进一步减少神经、血管的损伤，提高了手术的治愈率，脑立体定向及功能外科的开展，为省内首创。处于省内领先地位。